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Gegründet wurde die Siedlung im Jahre 44 v. Chr, ihre Blütezeit erlebte die Stadt vom 1. bis zum 3. Jahrhundert unserer Zeitrechnung. Sie besaß zur damaligen Zeit wohl etwa 20.000 Einwohner.
Ein starkes Erdbeben zerstörte im Jahre 250 die Stadt in erheblichem Maße. Hinzu kamen weitere Zerstörungen durch Einfälle der Alamannen und/oder marodierende römische Truppen.
In der Folge bildeten sich zwei neue Siedlungen, "die beiden Augst", die gewissermaßen die Kerne der heutigen Ortschaften Augst und Kaiseraugst bilden.
Beide bildeten aber zunächst eine Ortschaft mit dem Namen Augst. Im Jahre1442 aber wurde diese Ortschaft entlang der Flüsse Ergolz und Violenbach geteilt. Westlich der Grenze blieb das Gebiet Herrschaftsbereich von Basel, welches sich 1501 als Kanton der Schweizerischen Eidgenossenschaft anschloss. Augst wurde 1833 schließlich Teil des Kantons Basel-Landschaft.
Der östlich von Ergolz und Violenbach liegende Teil kam unter habsburgische Herrschaft. Zur besseren Unterscheidung wurde dieser Ort nun mit dem Namen "Kaiseraugst" versehen. Dieser Ort kam erst 1803 zur Schweiz hinzu, nachdem die habsburgischen Herrschaftsgebiete durch Napoleons Kriege verloren gingen und sich schließlich zum Kanton Aargau zusammenschlossen und der Schweiz beitraten.