Bei einigen Päpsten ist es zudem schwierig festzustellen, ob sie rechtmäßig oder unrechtmäßig im Amt waren. Die Gründe hierfür liegen unter anderem in der schwierigen Quellenlage. Als erster Gegenpapst gilt Hippolyt und als letzter Felix V (1439 - 49).

Auch heute gibt es noch Männer, die Johannes Paul II ablehnen (Sedisvakantismus) und selbst den Anspruch erheben, der rechtmäßige Papst zu sein, etwa Clemente Dominguez y Gomez (Gregor XVII) oder Lucian Pulvermacher (Pius XIII). Allerdings unterscheiden diese sich von den historischen Gegenpäpsten insofern, dass sie keine Unterstützung in der kirchlichen Hierarchie genießen und nur einige Tausend Anhänger mit starker regionaler Begrenzung haben.