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Der Hamiltonoperator H entspricht der beobachtbaren Größe der Gesamtenergie des Systems. Die Eigenvektoren von H, als |a〉 notiert, liefern einen Satz orthonormaler Basisvektoren im Hilbertraum. Das Spektrum der erlaubten Energieniveaus des Systems ist durch die Eigenwerte Ea gegeben:
Je nach dem Hilbertraum des Systems, kann das Energiespektrum diskret oder kontinuierlich sein. In der Tat gibt es Systeme, die in manchen Wertebereichen ein kontinuierliches und in anderen ein diskretes Energiespektrum aufweisen. Ein Beispiel dafür ist ein endlicher Potentialtopf, in dem gebundenen Zustände mit diskreten negativen Energien und freie Zustände mit kontinuierlichen positiven Energien auftreten.
Der Hamiltonoperator beschreibt auch die zeitliche Entwicklung eines Quantenzustandes. Wenn |ψ(t)〉 der Zustand des Systems zur Zeit t ist, dann