Kernporen sind kompliziert gebaute Komplexe in der Kernhülle von eukaryontischen Zellen, die nicht nur einfache Löcher darstellen. Der Rand der Pore ist außen wie innen mit je 8 Partikeln besetzt, die aus Ribonukleoproteinen bestehen. Speichenartige Fortsätze ragen zum Mittelpunkt der Pore, wo ein Zentralgranulum sitzt, das ebenfalls einen Ribonukleoproteinkomplex darstellt.
Größere Teilchen mit einem Durchmesser von bis zu 2 Nanometern können die Kernporen passieren. Durch sie hindurch werden etwa mRNA-Moleküle vom Inneren eines Zellkerns ins Cytoplasma transportiert. Der Transport solcher Moleküle durch eine Kernpore erfordert Energie, die in Form von ATP bereitgestellt wird.
