La proteómica intenta resolver cuestiones como estas: ¿Qué proteinas determinan los genes que hay en el genoma humano? ¿Qué función tienen las proteinas?

Conocer el proteoma de un organismo es tener una imagen dinámica de todas las proteínas expresadas por ese organismo, en un momento dado y bajo determinadas condiciones concretas de tiempo y ambiente. Las células expresan varios miles de proteínas diferentes y cada una de ellas puede experimentar numerosas modificaciones en respuesta a microambientes diferentes.

Cuando una célula está siendo atacada por un virus, la células produce anticuerpos. Esos anticuerpos son proteínas. Esos anticuerpos sólo se producen si hay ese virus, y no se producen si no lo hay. Lo mismo ocurre con otras condiciones como calor, o frío, o un millón de cosas. Todas las proteínas que se producen en un momento determinado y bajo ciertas condiciones se llama proteoma.

La proteómica es más general que uno de los proteomas derivados de un genoma.