Certains éléments laissent supposer qu'il pourrait être le père de la reine solaire Néfertiti. C'est cette place qui lui aurait permis de légitimer son accession au trône. Sous le règne d'Akhénaton, il a le titre de « divin père », ou une sorte de grand prêtre. Il est le concurrent direct de Horemheb, dernier roi de la XVIIIe dynastie. Aÿ tente, lors du règne de Toutankhamon, de le renverser pour prendre son trône, ce qui arriva, et il n'est pas impossible que le jeune roi soit mort de façon violente, mais pas forcément par Aÿ. Quoi qu'il en soit, son règne est très court: deux ans, et il fit construire une jolie tombe dans la Vallée des Singes.