Après avoir réprimé cette rébellion, Darios décida d'envahir la Grèce. L'armée perse débarqua en -490 dans la baie de Marathon à quarante kilomètre d'Athènes. Darios 1er commandait de 100 000 à 200 000 soldats perses selon les versions. Les Grecs n'étaient qu'environ 10 000! Conduits par le stratège Miltiade, les hoplites athéniens enserrant l'armée des Perses causèrent de lourdes pertes, prirent sept vaisseaux et rejetèrent les Perse à la mer. Ainsi s'acheva la première guerre médique. Cette victoire stratégique devint symbolique pour les Grecs et conféra un grand prestige à Athènes.