En réalité, sa mère, la reine Brunehaut assuma l'essentiel du pouvoir jusqu'à sa mort. La majorité de Childebert fut proclamée une première fois en 585, puis lors du pacte d'Andelot en 587. Grâce à ce pacte, il devenait héritier de la Bourgogne et de l'Orléanais après avoir été adopté par son oncle, le roi Gontran.

Pratiquant une politique d'alliance avec les Byzantins contre les Lombards d'Italie, Childebert a mené les dernières expéditions austrasiennes dans cette région. Il est aussi connu pour avoir complété la loi salique par un décret.