Exemple d'un logiciel d’exploitation des données
A partir des intensités diffractées et de la relation inverse (réseau réciproque - réseau réel), le logiciel utilisé (Denzo) va déterminer les axes et centres de symétrie du cristal et proposer le système cristallin le plus probable parmi les sept existants. C’est ensuite à l’utilisateur de choisir le groupe d’espace (réseau de Bravais) le plus approprié : le système choisi est celui qui a la plus haute symétrie afin d’avoir la meilleure résolution (c’est généralement à la fin de l’analyse, lorsque toutes les positions atomiques sont déterminées que peut être précisé le groupe d’espace). Des paramètres de maille sont alors proposés.
Le facteur de reliabilité R permet de calculer le degré de fiabilité de la maille proposée par rapport à la structure cristalline réelle. Quand il atteint une valeur suffisamment faible cela signifie que le modèle de maille est acceptable ; on peut alors passer à l’étape suivante c'est-à-dire l'affinement des paramètres de maille et l'intégration des intensités diffractées.
Les intensités diffractées sont caractéristiques de la nature et de la position des atomes et la densité électronique en tout point de la maille est fonction des intensités diffractées ; c’est pourquoi il est nécessaire d’intégrer un grand nombre de “ taches ”, correspondant à l’ensemble des réflexions sur le réseau cristallin (ensemble des mailles).
Le programme utilisé permet la corrélation entre les paramètres de maille, le fichier de référence obtenu précédemment et la formule du composé moléculaire attendue. On rentre la formule moléculaire du composé espéré dans le programme qui va affecter les atomes aux densités électroniques, les maxima d’intensité correspondant aux plus gros atomes. On affine alors la structure cristalline par tâtonnement.
