Une guerre sainte est une guerre lancée au nom d'un Dieu ou approuvée par une religion. Compte-tenu du caractère structurant pour les hommes et les peuples de leur foi, une telle guerre est généralement particulièrement longue et dure.

Elle peut-être offensive (dans ce cas, pour convertir, chasser ou anéantir des ennemis religieux), ou défensive (lorsque les dignitaires religieux estiment que la défaite aura un impact crucial sur leur foi, en raison des croyances de l'ennemi ou de la nature sacrée des lieux en cause).

Parmi les guerres se retrouvent les croisades et le jihad. Les chrétiens organisèrent des croisades au Moyen Âge pour tenter de récupérer Jérusalem ou pour lutter contre les Cathares. Les guerres de Religions sont également à compter comme des guerres saintes. Chez les musulmans, « jihad » désigne souvent les guerres saintes.