Comme son nom l'indique, l'église Saint-Jean-le-Rond, accolée à Notre-Dame de Paris, fut d'abord un baptistère. Si la date de sa construction demeure incertaine, on sait qu'elle fut désaffectée et sans doute détruite en 1748. Ce qui n'empêche pas Victor Hugo de l'évoquer dans Notre-Dame de Paris. Elle avait le statut de paroisse, et on y célébrait le culte de sainte Geneviève : la légende veut en effet qu'au Ve siècle celle-ci ait réuni dans le baptistère les femmes parisiennes pour les exhorter à lutter contre Attila par leurs prières. Une autre église Saint-Jean-le-Rond existe à Auxerre.
Jean le Rond d'Alembert a été retrouvé, nourrisson, abandonné sur les marches de cette église.