ニューロン間、あるいはニューロンと他種細胞間に形成される神経活動に関わる接合部位とその構造をシナプスといい、化学シナプスと電気シナプスがある。情報を伝える方の細胞をシナプス前細胞、伝えられる方の細胞をシナプス後細胞という。より広範に見られる化学シナプスでは情報伝達は一方向に行われ、興奮がシナプスに達するとシナプス小胞が細胞膜に融合しシナプス間隙に神経伝達物質が放出される。神経伝達物質がシナプス後細胞に存在する受容体に結合することで刺激が伝達されて行く。

発生過程でのシナプスの形成は、伸長する軸索の先端に存在する成長円錐が標的に到達した時に開始する。