その神概念は伝統的な三位一体を三神論として退け、サベリウス派に近い、父が子なる神イエス・キリストとなり受難したというものである。ただし聖霊を非人格的に解釈する点でサベリウス派と異なる。聖書の範囲に関しても、正統信仰と大幅に異なる独自の解釈で知られる。

またスヴェーデンボリはルター派教会に対する批判を行い、異端宣告を受けそうになった。国王の庇護によって異端宣告は回避されたが、スヴェーデンボリは英国に亡命し生涯スウェーデンには戻らなかった。

彼の死後、彼の思想への共鳴者が集まり、新エルサレム教会（新教会　New Church とも）を創設した。

スヴェーデンボリへの反応は広く、イマヌエル・カントの『視霊者の夢』、フリードリヒ・シェリングの『クラーラ』など、スヴェーデンボリの幻視を扱った思想書も存在する。