健康保険を利用する保険診療は保険指定された医療機関で保険医指定された医師によって行われ、診療報酬が定められている。保険金は医療機関へ直接支払われ、このとき医療機関が保険者に請求する明細をレセプトと呼ぶ。

保険で認められていない治療法（未認可の治療薬など）や、要医療状態以外に対する医療行為（通常の歯列矯正や美容整形など）は全額患者の自己負担となり、この場合診療報酬は医療機関の裁量で設定することができる。このような診療は自由診療と呼ばれる。

一連の医療行為の中で保険診療と自由診療が混在することは混合診療と呼ばれ認められていない。法的には、診療の一部でも保険で未認可の医療行為が含まれていれば、それは自由診療として全額自己負担でなければならない。しかし医学は日進月歩であり、未認可であっても学問的には確立された治療法も存在するため、保険制度とつじつまを合わすため架空の病名をレセプトに記載するレセプト病名という行為が半ば常識となっている。

健康保険の種類