26人の内訳は、日本人が20人、スペイン人が5人、ポルトガル人（とインド人のダブル）が1人であった。彼らは耳と鼻を削がれ、洛中（京都）を引き回された。その後長崎西坂にて十字架に縛られ槍で刺され殺された。この模様は当時長崎にいたルイス・フロイスによって記録された。

なおこの処刑は後年ローマへ伝わり、処刑された26名はローマ教皇によって殉教者とされた。以降「ニ十六聖人」と呼ばれる事になる。

殉教した地は現在公園となり、その公園には記念館とレリーフがある。

26聖人の名前

• 聖フランシスコ吉
• 聖パウロ鈴木
• 聖コスメ竹屋
• 聖ガブリエル
• 聖ペトロ助四郎
• 聖ヨハネ絹屋
• 聖ミカエル小崎
• 聖トマス小崎
• 聖トマス談義者
• 聖ディエゴ喜斎
• 聖フランシスコ医師
• 聖パウロ三木
• 聖ヨアキム榊原
• 聖パウロ茨木
• 聖レオ烏丸
• 聖ボナベントゥラ
• 聖ヨハネ草庵（五島）
• 聖マチアス
• 聖ルドビゴ茨木
• 聖フランシスコ・デ・サンミゲル
• 聖アントニオ
• 聖フランシスコ・ブランコ
• 聖マルチノ・デ・ラ・アセンシオン
• 聖ペトロ・バプチスタ
• 聖ゴンザロ・ガルシア
• 聖フィリッポ・デ・ヘスス