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日本では、日本海海戦において、東郷平八郎連合艦隊指令長官の座乗する旗艦三笠がZ旗をあげ士気の高揚を図ったとのエピソードで有名。日本海海戦以後、日本海軍では重要な艦隊戦の際にZ旗を揚げることが慣例化した。この際の意味は、「皇国の興廃この一戦にあり、各員一層奮励努力せよ」ということである。
海戦に際してZ旗を揚げるのは、トラファルガーの海戦におけるネルソン提督の行動に倣ったものとの説もあるが、いずれにしろ発祥は、"Z"がアルファベットの最後の文字である事から、「後はない」という決戦の意思として用いられたものと思われる。